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Download All Information: Die Gattung Acanthamoeba findet sich in erster Linie als freilebende Protozoen in natürlichen Lebensräumen, kommt aber auch als Erreger von Krankheiten bei Mensch und Tier vor. Acanthamoeba dient als Wirt für eine Vielzahl von pathogenen Bakterien wie Mycobacterium avium. Ein Befall mit Acanthamoeba führt zu einer potenziell sehkraftbedrohenden Keratitis durch Kontaktlinsen, zu schweren Infektionen anderer Organe und zu einer tödlichen granulomatösen Amöbenenzephalitis. Es sind mehr als 20 Acanthamöbenarten bekannt, die sich in drei morphologische Gruppen (Gruppe I, II und III) und 22 Genotypen (T1-T22) einteilen lassen. Einige Arten (A. castellanii (T4), A. lugdunensis (T4), A. polyphaga (T4), A. rhysodes (T4), A. quina (T4), A. palestinensis (T2), A. griffinii (T3), A. lenticulata (T5), A. astronyxis (T7), A. culbertsoni (T10), A. hatchetti (T11), A. healyii (T12), A. byersi (T18) und A. divionensis) wurden kürzlich mit menschlichen Erkrankungen in Verbindung gebracht. Der Genotyp T4 gilt als der wichtigste Genotyp sowohl bei Infektionen des Auges als auch des ZNS. Der Literatur zufolge ist der Genotyp T4 der am häufigsten vorkommende Acanthamöben Genotyp, der weltweit Keratitis verursacht (ca. 86 %) (Diehl et al., 2021).
Beschreibung: ParoReal® Kit Acanthamoeba T4 ist ein nicht automatischer IVD Test zum qualitativen Nachweis der DNA (18S rRNA Gen) von Acanthamoeba Arten des Genotyp T4 (A. castellani, A. lugdunensis, A. mauritaniensis, A. polyphaga, A. rhysodes, A. royreba) mittels real-time Polymerase-Kettenreaktion. Der Test detektiert nicht andere Acanthamoeba Genotypen (T3, T15, T11, and T5), welche ebenfalls Keratitis verursachen. Geeignete Untersuchungsmaterialien sind DNA-Extrakte aus Proben von humanen klinischen Proben assoziiert mit Keratitis (Augenabstriche, Hornhautbiopsien, Augenpunktate, Hornhautscrapings) sowie von Kontaktlinsen und Kontaktlinsenflüssigkeit. Dieser Test ist für Patienten aller Altersgruppen mit Verdacht auf eine Infektion mit Acanthamoeba Genotyp T4 (möglicher Erreger von Acanthamoeba Keratitis, AK) geeignet und dient in Kombination mit der Krankengeschichte und zusätzlichen klinischen Informationen zur Unterstützung der Diagnose einer Acanthamoeba Infektion. Der Test ist für den professionellen Gebrauch und darf nur von Fachpersonal verwendet werden, das auf real-time PCR und in vitro Diagnose Verfahren geschult wurde. Acanthamoeba Arten des Genotyp T4 verursachen weltweit ca. 86 % der Acanthamoeba Keratitis (Diehl et al., 2021). Das 18S rRNA Gen ist ein Multicopy Gen und bis zu 22-mal im haploiden Genom von Acanthamoeba enthalten. Da Acanthamoeba jedoch polyploid ist, enthält jede Zelle etwa 600 rRNA-Gene (Yang et al., 1994). Eine Sonden-spezifische Amplifikationskurve im Fluoreszenzkanal für FAM (530 nm) zeigt die Amplifikation der Acanthamoeba spezifischen DNA. Die interne DNA-Positivkontrolle (DNA IPC) wird im Cy5 Kanal detektiert und dient als Kontrolle der DNA-Extraktion und real-time PCR Inhibitionskontrolle. Das Target für die DNA IPC (artifizielle Target DNA) wird während der Probenextraktion zugegeben.
| Bestellnummer | Reaktionen | Kanal Erreger | Kanal IPC | Ziel |
|---|---|---|---|---|
| DHUP00153 | 50 | FAM | Cy5 | 18S rRNA |
Lieferung bei: +4 °C cool packs
- Amplifikation und Nachweis von: 18S rRNA Gen von Acanthamoeba Genotyp T4
- Real-time PCR mit rapid hot-start Taq DNA Polymerase
- ROX™ Farbstoff als passive Referenz
- Internes Positiv Kontrollsystem zum Ausschluss falsch-negativer Ergebnisse
- Optimiert für den Umgang mit PCR Inhibitoren
- PCR Geräte: läuft auf allen gängigen real-time PCR Instrumenten
- Harmonisierte Thermoprofile für gleichzeitige Analyse von DNA und RNA in einem Lauf
PCR Geräte: Dieser Test wurde mit dem ABI® 7500 Fast Real-time PCR System (Thermo Fisher Scientific, Fast Cycle Parameter werden nicht unterstützt) validiert und zusätzlich mit dem LightCycler® 480 Instrument II (Roche), QuantStudio™ 7 real-time PCR system (Thermo Fisher Scientific), Mic instrument (bio molecular systems), CFX Opus Real-time PCR System (Bio-Rad), CFX Dx (Bio-Rad) und T-COR 8 (Tetracore) getestet. Er eignet sich aber auch für andere real-time PCR Geräte, die Fluoreszenz im FAM und Cy5 Kanal messen und differenzieren können (z.B. QuantStudio™ 7 real-time PCR system (Thermo Fisher Scientific), qTOWER3G (Analytik Jena), cobas z 480 Analyzer (Roche)). Bei Verwendung von PCR-Plattformen, die nicht von ingenetix getestet wurden, muss eine Evaluierung der Multiplex-PCR durchgeführt werden. Bitte beachten Sie, dass manche PCR-Plattformen vor der Verwendung einer Multiplex-PCR mit den jeweiligen Farbstoffen kalibriert werden müssen.